日前,由中国水产科学研究院淡水渔业研究中心水产遗传育种研究室苏胜彦博士等人发明的“DNA compare software 1.0”获得国家版权局的计算机软件著作权授权登记,授权号:2013SR112380。
本平台通过构建MySQL数据库和依据Smith Waterman 算法进行序列比对,开发了DNAcomparisons1.0,开发语言使用JAVA,源代码可在Windows,Unix和Linux上使用。根据使用者的需要,可依据相似度分值进行排序和选择,对输入的待检测序列可以选择一条或是多条,对输出结果的多少也可进行数量的选择,并提供如果待检测序列是新品种序列的话,可根据入库的编码要求,进行登记入库。入库序列采用FASTA格式。同时该库具有按照条形码种质鉴定的要求使序列标准化的功能。